在实际操作中，各地税局会要求存在滞留发票的公司必须对滞留的原因加以说明，同时也会对存在疑点的公司进行现场检查。有些公司存在滞留发票，目的是想偷漏税，隐瞒销售收入同时隐瞒抵扣发票，使税负从表面上看与正常公司相符，这就造成很多该抵扣的发票不去税局抵扣，造成发票滞留。一般情况下，增值税专用票的税务管理很严格，税局一旦发现问题会予以追究。
增值税发票只要一经防伪税控系统开出，而购货方未去认证则该发票就没有对应的抵扣信息，就会造成滞留。那么，哪些原因导致了滞留发票的产生呢？中华会计网校小编对这一问题的产生进行了总结和梳理，即，滞留发票产生的原因主要包括：
1.属于购进免税货物用，专用发票不得认证；
2.属于购进非应税项目用，专用发票不得认证；
3.销货方未将专用发票交给购货方，造成存根联滞留；
4.购货方接到专用发票超过180日认证期而无法认证抵扣，造成存根联滞留；
5.购货方在小规模纳税人期间取得对方开具的专用发票不能抵扣；
6.购货方发生走逃或注销。
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